ememblvep

doi:10.18129/b9.bioc.ensemblvep

r接口到ENEMBL变体效应预测变量

生物导体版本:版本(3.15)

查询通过PERL API查询Ensembl变体效应预测器。

作者:Valerie Obenchain和Lori Shepherd

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ ememblvep”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ ememblvep”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ememblvep”)

PDF R脚本 ememblvep
PDF R脚本 PREV90ENSEMBLVEP
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.38.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(9。5年)
执照 艺术2.0
要看 方法,生物基因,,,,基因组机,,,,变体
进口 S4VECTORS(> = 0.9.25),生物弦,,,,总结性特征,,,,GenomeInfodB,统计
链接
建议 运行
系统要求 必须安装Ensembl VEP(API版本105)和Perl模块DBI和DBD :: MySQL。请参阅包装和ENMEMBL安装说明:http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/vep/script/vep_download.html#installer
增强
URL
取决于我
进口我 mmappr2,,,,TVTB
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Ensemblvep_1.38.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉) Ensemblvep_1.38.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ensemblvep
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ememblvep
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ensemblvep/
软件包下载报告 下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包 来源存档

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网