边缘
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.ded
提取差异基因表达
生物导体版本：版本（3.15）
Edge软件包实现了对全基因组基因表达研究进行差异表达分析的方法。使用最佳发现程序和普遍的似然比测试（相当于F检验和T检验）进行显着性测试，用于一般研究设计。可以使用特殊功能来促进分析常见研究设计，包括时间课程实验。SNM，SVA和QVALUE等其他软件包都集成在边缘，以提供广泛的基因表达分析工具。
作者：John D. Storey，Jeffrey T. Leek和Andrew J. Bass
维护者：John D. Storey
引用（从r内，输入引用（“边缘”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ edge”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“边缘”）
| R脚本 | 边缘包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（7年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.1.0），生物酶 |
| 进口 | 方法，花键，SVA，，，，SNM，Jackstraw，QVALUE（> = 1.99.0），大量的 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/jdstorey/Edge |
| BugReports | https://github.com/jdstorey/edge/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | edge_2.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | edge_2.28.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | edge_2.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/edge |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/边缘 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/edge/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
