dyebias

DOI:10.18129 / B9.bioc.dyebias

用于校正幻灯片依赖基因特异性染料偏倚的GASSCO方法

生物导体版本:发布(3.12)

许多双色杂交遭受染料偏倚，这是基因特异性和玻片特异性。前者取决于用于标记的核苷酸的含量;后者取决于标注百分比。到目前为止，幻灯片依赖性还没有被认识到，这使得解决人工制品成为不可能。如果有合理数量的染料交换杂交对，或者相同的杂交对相同的杂交，可以使用GASSCO方法估计和校正基因偏差和幻灯片偏差(Margaritis et al.， Mol. Sys.)。生物杂志。5:266 (2009)，doi:10.1038/msb.2009.21)

作者:Philip Lijnzaad和Thanasis Margaritis

维护者:Philip Lijnzaad

安装

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如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“dyebias”)

PDF	R脚本	染料偏差纠正
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.50.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (R-2.9)(12年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 1.4.1),marray,Biobase
进口
链接
建议	limma,转换,GEOquery,dyebiasexamples、方法
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad
取决于我
进口我
建议我	dyebiasexamples
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包档案

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源包	dyebias_1.50.0.tar.gz
Windows二进制	dyebias_1.50.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	dyebias_1.50.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dyebias
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ dyebias
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/
包下载报告	下载数据