drugTargetInteractions

DOI:10.18129 / B9.bioc.drugTargetInteractions

药物相互作用

Bioconductor版本:版本(3.16)

提供实用工具以确定药物小分子或基因/蛋白质的交互集标识符。所需的药物相互作用信息试图从本地SQLite ChEMBL数据库的实例。ChEMBL已经选择了这个目的,因为它提供了最全面的和最佳annotatated知识资源药物信息在公共领域。

作者:托马斯Girke (cre, aut)

维护人员:托马斯Girke <托马斯。在ucr.edu girke >

从内部引用(R,回车引用(“drugTargetInteractions”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“drugTargetInteractions”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“drugTargetInteractions”)

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细节

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版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,R (> = 4.1)
进口 跑龙套,RSQLite,UniProt.ws,biomaRt,ensembldb,BiocFileCache,dplyr,rappdirs,AnnotationFilter,S4Vectors
链接
建议 RUnit,BiocStyle,knitr,rmarkdown,ggplot2,reshape2,DT,EnsDb.Hsapiens.v86
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions
BugReports https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 drugTargetInteractions_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 drugTargetInteractions_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64) drugTargetInteractions_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) drugTargetInteractions_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drugTargetInteractions
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ drugTargetInteractions
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/drugTargetInteractions/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/drugTargetInteractions/
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