Bioconductor版本:版本(3.16)
提供实用工具以确定药物小分子或基因/蛋白质的交互集标识符。所需的药物相互作用信息试图从本地SQLite ChEMBL数据库的实例。ChEMBL已经选择了这个目的,因为它提供了最全面的和最佳annotatated知识资源药物信息在公共领域。
作者:托马斯Girke (cre, aut)
维护人员:托马斯Girke <托马斯。在ucr.edu girke >
从内部引用(R,回车引用(“drugTargetInteractions”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“drugTargetInteractions”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“drugTargetInteractions”)
HTML | R脚本 | 药物相互作用 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | 方法,R (> = 4.1) |
进口 | 跑龙套,RSQLite,UniProt.ws,biomaRt,ensembldb,BiocFileCache,dplyr,rappdirs,AnnotationFilter,S4Vectors |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocStyle,knitr,rmarkdown,ggplot2,reshape2,DT,EnsDb.Hsapiens.v86 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions |
BugReports | https://github.com/girke-lab/drugTargetInteractions |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | drugTargetInteractions_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | drugTargetInteractions_1.6.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | drugTargetInteractions_1.6.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | drugTargetInteractions_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drugTargetInteractions |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ drugTargetInteractions |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/drugTargetInteractions/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/drugTargetInteractions/ |
包下载报告 | 下载数据 |