drawProteins

DOI:10.18129 / B9.bioc.drawProteins

蛋白质包画图表从Uniprot API输出

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包蛋白质图表来自Uniprot API输出。从JSON返回的命令,它会创建一个dataframe Uniprot功能的API。这个几何学dataframe可以使用基于ggplot2和基础R蛋白示意图。

作者:保罗•布伦南(aut (cre)

维修工:保罗·布伦南在gmail.com < brennanpincardiff >

从内部引用(R,回车引用(“drawProteins”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“drawProteins”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“drawProteins”)

HTML R脚本 使用drawProteins
HTML R脚本 使用extract_transcripts drawProteins
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 4.0)
进口 ggplot2、httr dplyr、readr tidyr
链接
建议 covr、testthat knitr rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins
BugReports https://github.com/brennanpincardiff/drawProteins/issues/new
取决于我
进口我 factR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 drawProteins_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 drawProteins_1.20.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) drawProteins_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) drawProteins_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drawProteins
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ drawProteins
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/drawProteins/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/drawProteins/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网