diffloop
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doi：10.18129/b9.bioc.diffloop
从染色质拓扑数据中识别差异DNA回路
生物导体版本：版本（3.13）
一套用于子集，可视化，注释和统计学的工具，分析一个或多个CHIA-PET实验的结果或推断染色质环的其他测定法。
作者：Caleb Lareau [AUT，CRE]，Martin Aryee [AUT]
维护者：Caleb lareau
引用（从r内，输入引用（“ diffloop”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ diffloop”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ diffloop”）
| html | R脚本 | Diffloop：从染色质拓扑数据中识别差异DNA回路。 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | |
| 进口 | 方法，基因组机，，，，foreach，，，，plyr，，，，dplyr，，，，RESHAPE2，，，，GGPLOT2，，，，矩阵，，，，寿司，，，，EDGER，，，，Locfit，，，，Statmod，，，，Biomart，，，，GenomeInfodB，，，，S4VECTORS，，，，iranges，grdevices，图形，统计，utils，生物酶，，，，readr，，，，Data.Table，，，，rtracklayer，，，，pbapply，，，，林玛 |
| 链接 | |
| 建议 | deseq2，，，，diffloopdata，，，，Ggrepel，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/aryeelab/diffloop |
| BugReports | https://github.com/aryeelab/diffloop/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | diffloop_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | diffloop_1.20.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | diffloop_1.20.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffloop |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/diffloop |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/diffloop/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
