生物导体版本:版本(3.15)
该软件包为Derfinder软件包的结果提供了绘图功能。这有助于分开将这些图与Derfinder的核心功能制作所需的图形依赖关系。
作者:Leonardo Collado-Torres [AUT,CRE],Andrew E. Jaffe [aut],Jeffrey T. Leek [Aut,THS]
维护者:leonardo collado-torres
引用(从r内,输入引用(“ derfinderplot”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ derfinderplot”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ derfinderplot”)
html | R脚本 | DERFINDERPLOT简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.30.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(7。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 3.2) |
进口 | 德芬德(> = 1.1.0),GenomeInfodB(> = 1.3.3),GenomicFeatures,,,,基因组机(> = 1.17.40),GGBIO(> = 1.13.13),GGPLOT2,图形,grdevices,iranges(> = 1.99.28),林玛, 方法,plyr,,,,rcolorbrewer,,,,RESHAPE2,,,,S4VECTORS(> = 0.9.38),秤,UTILS |
链接 | |
建议 | Biovizbase(> = 1.27.2),Bumphunter(> = 1.7.6),derfinderdata(> = 0.99.0),SessionInfo,,,,尼特(> = 1.6),生物使用(> = 2.5.19),org.hs.eg.db,,,,Refmanager,,,,rmarkDown(> = 0.3.3),测试,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,COVR |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/leekgroup/derfinderplot |
BugReports | https://support.bioconductor.org/t/derfinderplot |
取决于我 | |
进口我 | BrainflowProbes,,,,recountworkflow |
建议我 | 德芬德,,,,基因组态,,,,地区报告 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | derfinderplot_1.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | derfinderplot_1.30.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | derfinderplot_1.30.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderplot |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/derfinderplot |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/derfinderplot/ |
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