生物导体版本:版本(3.15)
该软件包从3C数据中发现了中级染色质重塑。3C数据本质上是局部的。它在限制酶消化片段和首选的“观点”区域之间进行了相互作用。通过固定此数据并使用置换测试,该软件包可以测试来自两种细胞类型或两种处理的数据之间的相互作用计数的统计学意义变化。
维护者:迈克尔·夏皮罗
引用(从r内,输入引用(“ deltacapturec”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ DeltaCapturec”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ deltacapturec”)
html | R脚本 | 三角洲捕获-C |
参考手册 | ||
文本 | 执照 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | iranges,,,,基因组机,,,,总结性特征,,,,GGPLOT2,,,,deseq2,,,,Tictoc |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | deltacapturec_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | deltacapturec_1.10.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | deltacapturec_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deltacapturec |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/deltacapturec |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/deltacapturec/ |
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