碎片器

doi：10.18129/b9.bioc.debrowser

交互式差分分析分析浏览器

生物导体版本：版本（3.13）

生物信息学平台包含用于差异基因和区域表达研究的交互式图和表。允许以交互式和更快的方式更深入地看到表达数据。通过更改参数，用户可以轻松地发现以前从未做过的数据的不同部分。手动创建和查找这些图需要时间。借助DeBrowser用户可以在不编写任何代码的情况下准备地图。在现场进行差异表达，PCA和聚类分析，并在各种图中显示了结果，例如散点，杆，盒子，火山，MA图和热图。

作者：Alper kucukural ，onur yukselen ，manuel garber

维护者：alper kucukural

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ deBrowser”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ deBrowser”）

html	R脚本	DeBrowser Vignette
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.20.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（5年）
执照	GPL-3 +文件执照
要看	R（> = 3.5.0）
进口	闪亮的，，，，jsonlite，，，，Shinyjs，，，，发光的dashboard，，，，丝绸，，，，GPLOTS，，，，DT，，，，GGPLOT2，，，，rcolorbrewer，，，，注释，，，，AnnotationDbi，，，，deseq2，，，，剂量，，，，Igraph，grdevices，图形，统计，utils，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，Stringi，，，，RESHAPE2，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，林玛，，，，EDGER，，，，clusterProfiler， 方法，SVA，，，，rcurl，，，，富集，，，，颜色，，，，情节，，，，热图，，，，哈曼，，，，PathView，，，，apeglm，，，，阿什
链接
建议	测试，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，尼特，，，，R.RSP
系统要求
增强
URL	https://github.com/umms-biocore/debrowser
BugReports	https://github.com/umms-biocore/debrowser/issues/new
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	deBrowser_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	deBrowser_1.20.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	deBrowser_1.20.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/debrowser
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/debrowser
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/debrowser/
软件包下载报告	下载统计