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ddPCRclust
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ddPCRclust
ddPCR数据的聚类算法
Bioconductor版本:发行版(3.16)
ddPCRclust算法可以自动定量多达四个目标的非正交ddPCR反应的cpd。为了确定每个目标的正确液滴数，关键是要识别所有簇，并根据它们的位置正确标记它们。有关可以分析哪些数据以及模板需要如何格式化的更多信息，请查看小插图。
作者:Benedikt G. Brink [aut, cre]， Justin Meskas [ctb]， Ryan R. Brinkman [ctb]
维护者:Benedikt G. Brink
引文(从R内，输入引用(“ddPCRclust”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“ddPCRclust”)
| R脚本 | 生物导体乳胶风格 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.5) |
| 进口 | plotrix，线索平行,ggplot2，openxlsx，R.utils，flowCore，flowDensity(> = 1.13.3),SamSPECTRAL，flowPeaks |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/bgbrink/ddPCRclust |
| BugReports | https://github.com/bgbrink/ddPCRclust/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | ddPCRclust_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ddPCRclust_1.18.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | ddPCRclust_1.18.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | ddPCRclust_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ddPCRclust |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ddPCRclust |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ddPCRclust/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ddPCRclust/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
