达斯珀

doi:10.18129/b9.bioc.dasper

从RNA测序数据中检测到宽大的剪接事件

生物导体版本:版本(3.13)

达斯珀的目的是从RNA-Seq数据中检测异常的剪接事件。DASPER将用作RNA-Seq的输入和覆盖数据,以计算患者与一组用户定义控件的每个剪接事件的偏差。达斯珀(Dasper)使用无监督的离群检测算法来对患者的每个剪接事件进行评分,其异常得分代表该剪接事件看起来异常的程度。

作者:David Zhang [AUT,CRE],Leonardo Collado-Torres [CTB]

维护者:David Zhang

引用(从r内,输入引用(“达斯珀”)):

安装

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if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dasper”)

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版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 4.0)
进口 蛇怪,,,,Biocfilecache,,,,生物比较,,,,Data.Table,,,,dplyr,,,,GenomeInfodB,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,iranges,,,,马格里特,,,,Megadepth, 方法,plyranges,,,,readr,,,,网状,,,,S4VECTORS,,,,Stringr,,,,总结性特征,,,,花花公子
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URL https://github.com/dzhang32/dasper
BugReports https://support.bioconductor.org/t/dasper
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Windows二进制 dasper_1.2.0.zip
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源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dasper
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dasper
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dasper/
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