生物导体版本:版本(3.13)
达斯珀的目的是从RNA-Seq数据中检测异常的剪接事件。DASPER将用作RNA-Seq的输入和覆盖数据,以计算患者与一组用户定义控件的每个剪接事件的偏差。达斯珀(Dasper)使用无监督的离群检测算法来对患者的每个剪接事件进行评分,其异常得分代表该剪接事件看起来异常的程度。
作者:David Zhang [AUT,CRE],Leonardo Collado-Torres [CTB]
维护者:David Zhang
引用(从r内,输入引用(“达斯珀”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ dasper”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Dasper”)
html | R脚本 | 达斯珀的简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | 蛇怪,,,,Biocfilecache,,,,生物比较,,,,Data.Table,,,,dplyr,,,,GenomeInfodB,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,iranges,,,,马格里特,,,,Megadepth, 方法,plyranges,,,,readr,,,,网状,,,,S4VECTORS,,,,Stringr,,,,总结性特征,,,,花花公子 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,COVR,,,,测试,,,,基因组态,,,,GGPLOT2,,,,ggpubr,,,,Ggrepel, 网格,编织,,,,尼特,,,,叙事,,,,rmarkDown,,,,SessionInfo,,,,rtracklayer,,,,蒂布尔 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/dzhang32/dasper |
BugReports | https://support.bioconductor.org/t/dasper |
取决于我 | |
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建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dasper_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | dasper_1.2.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | dasper_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dasper |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dasper |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dasper/ |
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