Bioconductor版本:发行版(3.16)
dStruct从RNA结构分析数据中识别差异反应区。dStruct与广泛的结构分析技术兼容,例如,SHAPE-MaP, DMS-MaPseq, Structure-Seq, SHAPE-Seq等。参见Choudhary等人,《基因组生物学》,2019年,了解基本方法。
作者:Krishna Choudhary [aut, cre],莎朗·阿维兰[au]
维护者:Krishna Choudhary
引文(从R内,输入引用(“dStruct”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“dStruct”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用“dStruct”进行差异RNA结构分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | 动物园,ggplot2,purrr,reshape2平行,IRanges,S4Vectors,rlang, grDevices, stats, utils |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat(> = 3.0.0) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/dataMaster-Kris/dStruct |
BugReports | https://github.com/dataMaster-Kris/dStruct/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | dStruct_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | dStruct_1.4.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | dStruct_1.4.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | dStruct_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dStruct |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dStruct |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/dStruct/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/dStruct/ |
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