- 家
- Biocumon 3.12.
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- CRLMM.
CRLMM.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.crlmm.
基因型调用（CRLMM）和Affymetrix SNP 5.0和6.0和Illumina阵列的复制编号分析工具
Biocometiond版本：释放（3.12）
更快地实现CRLMM特定于SNP 5.0和6.0阵列，以及特定于5.0,6.0和Illumina平台的副本编号工具。
作者：Benilton S Carvalho，Robert Scharpf，Matt Ritchie，Ingo Ruczinski，Rafael A Ireizarry
维护者：Benilton S Carvalho
引文（从R内，输入引文（“CRLMM”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：
if（！properenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“crlmm”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“CRLMM”）
| PDF. | 复制号码估计 | |
| PDF. | CRLMM Vignette - 下游分析 | |
| PDF. | r script. | CRLMM Vignette - 基因分型 |
| PDF. | 用于拷贝数分析的基础架构 | |
| PDF. | 副本数概述Vignettes | |
| PDF. | 用于拷贝数分析的预处理和基因分型illumina阵列 | |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.48.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 2.4（R-2.9）（12年） |
| 执照 | 艺术-2.0 |
| 依靠 | r（> = 2.14.0），oligoclasses.（> = 1.21.12），预处理核（> = 1.17.7） |
| 进口 | 方法，BioBase.（> = 2.15.4），生物根系那挚友（> = 1.23.2），Illuminaio那椭圆那mvtnorm.，样条键，统计数据，utils，格子那FF.那Foreach.那rcppeigen.（> = 0.3.1.2.1），MatrixStats.那vgam.，平行，图形，林马那伯普兰 |
| 链接到 | 预处理核（> = 1.17.7） |
| 建议 | hapmapsnp6.那Genomewidesnp6crlmm.（> = 1.0.7），ggdata.那Snpstats.那运行 |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 香草 |
| 建议我 | arraytv.那hapmap370k.那oligoclasses. |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | crlmm_1.48.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | crlmm_1.48.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | crlmm_1.48.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/crlmm. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocumon.org：包/ crlmm |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/crlmm/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
