crisprViz

DOI:10.18129 / B9.bioc.crisprViz

可视化功能CRISPR gRNAs

Bioconductor版本:版本(3.17)

提供了功能说明CRISPR可视化并指导rna (gRNAs)基因组核酸酶和应用程序跟踪。作品结合crisprBase和crisprDesign Bioconductor包。情节就是用Gviz框架。

作者:让-菲利普•福丁(aut (cre),卢克Hoberecht (aut)

维护人员:让-菲利普•福丁< fortin946 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“crisprViz”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“crisprViz”)

HTML	R脚本	介绍crisprViz
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文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.2.0),crisprBase(> = 0.99.15),crisprDesign(> = 0.99.77)
进口	BiocGenerics,Biostrings,BSgenome,GenomeInfoDb,GenomicFeatures,GenomicRangesgrDevices,Gviz,IRanges、方法、S4Vectors
链接
建议	AnnotationHub,BiocStyle,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38knitr rmarkdown,rtracklayer、testthat跑龙套
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/crisprVerse/crisprViz
BugReports	https://github.com/crisprVerse/crisprViz/issues
取决于我
进口我	crisprVerse
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	crisprViz_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	crisprViz_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	crisprViz_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	crisprViz_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/crisprViz
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ crisprViz
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/crisprViz/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/crisprViz/
包下载报告	下载数据