cqn

DOI:10.18129 / B9.bioc.cqn

条件分位数正常化

Bioconductor版本:版本(3.13)

标准化工具RNA-Seq数据,实现条件分位数归一化法。

作者:琼(织金)吴Kasper丹尼尔·汉森

维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“cqn”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cqn”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cqn”)

PDF R脚本 CQN条件分位数(归一化)
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文本 新闻

细节

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版本 1.38.0
Bioconductor自 BioC 2.9 (r - 2.14)(9.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.10.0),mclust,nor1mix统计数据,preprocessCore样条函数,quantreg
进口 样条函数
链接
建议 尺度,刨边机
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 exomePeak2,KnowSeq
进口我 tweeDEseq
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 cqn_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 cqn_1.38.0.zip
macOS 10.13(高山脉) cqn_1.38.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cqn
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cqn
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cqn/
包下载报告 下载数据

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