- 家
- Bioconductor 3.13
- 软件包
- cqn
cqn
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DOI:10.18129 / B9.bioc.cqn
条件分位数正常化
Bioconductor版本:版本(3.13)
标准化工具RNA-Seq数据,实现条件分位数归一化法。
作者:琼(织金)吴Kasper丹尼尔·汉森
维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“cqn”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cqn”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“cqn”)
| R脚本 | CQN条件分位数(归一化) | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.38.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(9.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.10.0),mclust,nor1mix统计数据,preprocessCore样条函数,quantreg |
| 进口 | 样条函数 |
| 链接 | |
| 建议 | 尺度,刨边机 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | exomePeak2,KnowSeq |
| 进口我 | tweeDEseq |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | cqn_1.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cqn_1.38.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | cqn_1.38.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cqn |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cqn |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cqn/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
