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coseq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.coseq
测序数据的共表达分析
Bioconductor版本:Release (3.15)
高通量测序数据中表达谱的共表达分析。使用自适应转换和混合模型或K-means算法对特征(例如基因)轮廓进行聚类，并提供模型选择标准(选择适当数量的聚类)。
作者:Andrea Rau [cre, aut]
，凯茜·毛吉斯-鲁梭[ctb]，安东尼·戈迪康-巴乔尼[ctb]
维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在inrae.fr>
引文(从R内，输入引用(“coseq”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“coseq”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | coseq |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.0.0)，SummarizedExperiment，S4Vectors |
| 进口 | 刨边机，DESeq2，capushe，Rmixmod，e1071，BiocParallel，ggplot2，尺度，HTSFilter，corrplot，HTSCluster， grDevices，图形，统计，方法，作文，mvtnorm |
| 链接 | |
| 建议 | Biobase，knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | coseq_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | coseq_1.20.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | coseq_1.20.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coseq |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/coseq |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/coseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
