CopyNumber.

DOI:10.18129 / b9.bioc.copynumber

惩罚最小二乘回归的单轨和多轨拷贝数数据的分割。

Biocometiond版本:释放(3.12)

惩罚最小二乘回归适用于适合分段常量曲线来复制数字数据以定位常量拷贝数的基因组区域。每个样本的单个分段有程序可用于每个样本的联合分割,以及来自SNP-arrays的两个数据轨道的联合分段。有几个绘图功能可用于可视化数据和分段结果。

作者:GRO Nilsen,KNUT LIESOEL和OLE CHRISTIAN LINGJAERDE。

维护者:Gro nilsen

引文(从R内,输入引文(“CopyNumber”)):

安装

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if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“copynumber”)

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细节

Biocviews. bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.30.0
在生物导体中以来 BIOC 2.12(R-3.0)(8年)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 2.10),生物根系
进口 S4Vectors.绞喉Genomicranges.
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源包 copynumber_1.30.0.tar.gz.
Windows二进制文件 copynumber_1.30.0.zip.(32-&64位)
Macos 10.13(高塞拉) CopyNumber_1.30.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/copynumber.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/复印件
包短网址 https://biocumon.org/packages/copynumber/
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