Biocometiond版本:释放(3.12)
惩罚最小二乘回归适用于适合分段常量曲线来复制数字数据以定位常量拷贝数的基因组区域。每个样本的单个分段有程序可用于每个样本的联合分割,以及来自SNP-arrays的两个数据轨道的联合分段。有几个绘图功能可用于可视化数据和分段结果。
作者:GRO Nilsen,KNUT LIESOEL和OLE CHRISTIAN LINGJAERDE。
维护者:Gro nilsen
引文(从R内,输入引文(“CopyNumber”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“copynumber”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“COPYNUMBER”)
PDF. | r script. | CopyNumber.PDF.PDF. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
版本 | 1.30.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.12(R-3.0)(8年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 2.10),生物根系 |
进口 | S4Vectors.那绞喉那Genomicranges. |
链接到 | |
建议 | |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | Shapenza. |
建议我 | pur |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | copynumber_1.30.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | copynumber_1.30.0.zip.(32-&64位) |
Macos 10.13(高塞拉) | CopyNumber_1.30.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/copynumber. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/复印件 |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/copynumber/ |
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