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conumee
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DOI:10.18129 / B9.bioc.conumee
增强人类基因组变异分析使用Illumina公司DNA甲基化数组
Bioconductor版本:版本(3.15)
这个包包含一组处理和绘制方法进行人类基因组变异(CNV)的分析使用Illumina公司450 k或史诗甲基化数组。
作者:Volker Hovestadt, Marc Zapatka
维护人员:Volker Hovestadt < conumee在hovestadt.bio >
从内部引用(R,回车引用(“conumee”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“conumee”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“conumee”)
| HTML | R脚本 | conumee |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.30.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(7年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),minfi,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19,IlluminaHumanMethylationEPICmanifest |
| 进口 | 方法、统计数据DNAcopy,rtracklayer,GenomicRanges,IRanges,GenomeInfoDb |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,minfiData,RCurl |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | CopyNeutralIMA |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | conumee_1.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/conumee |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ conumee |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/conumee/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
