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contiBAIT
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DOI:10.18129 / B9.bioc.contiBAIT
利用Strand-Seq数据改进早期构建基因组组装
Bioconductor版本:Release (3.15)
利用来自基因组被组装的生物体的多个单细胞的链遗传数据，contiBAIT可以将未桥接的contigs聚在一起形成假定的染色体，并在这些染色体中对contigs进行排序。
作者:Kieran O'Neill, Mark Hills, Mike Gottlieb
维护者:Kieran O'Neill
引文(从R内，输入引用(“contiBAIT”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“contiBAIT”)
| R脚本 | flowBi | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(6年) |
| 许可证 | BSD_2_clause +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，黑洞(> = 1.51.0.3),Rsamtools(> = 1.21) |
| 进口 | data.tablegrDevices,线索，集群，gplots，BiocGenerics(> = 0.31.6),S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，Rcpp，茶匙，GenomicFiles，gtools，rtracklayer，BiocParallel，DNAcopy，色彩，reshape2，ggplot2、方法、exomeCopy，GenomicAlignments，图 |
| 链接 | Rcpp，黑洞 |
| 建议 | BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | contiBAIT_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | contiBAIT_1.24.0.zip(64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | contiBAIT_1.24.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/contiBAIT |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/contiBAIT |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/contiBAIT/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
