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consensusSeekeR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.consensusSeekeR
使用基因组位置和基因组范围检测一组经验中的共识区域
Bioconductor版本:发行版(3.13)
该软件包从多个实验中比较基因组位置和基因组范围，以提取共同区域。所分析区域的大小是可调的，并且经验的数量是可调的，其中一个特征必须出现在一个潜在的区域中，才能将该区域标记为共识区域。
作者:Astrid Deschenes [cre, aut]， Fabien Claude Lamaze [ctb]， Pascal Belleau [aut]， Arnaud Droit [aut]
维护者:Astrid Deschenes
引文(从R内，输入引用(“consensusSeekeR”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("consensusSeekeR")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“consensusSeekeR”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 一组实验中一致性区域的检测 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 2.10)，BiocGenerics，IRanges，GenomicRanges，BiocParallel |
| 进口 | GenomeInfoDb，rtracklayer，stringr，S4Vectors、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，ggplot2，knitr，rmarkdown，RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/ArnaudDroitLab/consensusSeekeR |
| BugReports | https://github.com/ArnaudDroitLab/consensusSeekeR/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | RJMCMCNucleosomes |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | consensusSeekeR_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | consensusSeekeR_1.20.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | consensusSeekeR_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusSeekeR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/consensusSeekeR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/consensusSeekeR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
