调味品

DOI:10.18129 / B9.bioc.condiments

微分拓扑,进展和分化

Bioconductor版本:版本(3.13)

这个包封装许多函数进行微分拓扑分析。它着重于分析一个“使数据集与多个条件。虽然包主要是面向scRNASeq,但没有地方限制实际的输入格式。

作者:赫克托耳Roux de Bezieux (aut (cre),柯恩Van den Berge aut,施莱,凯利街(aut,施莱)

维修工:赫克托耳Roux de Bezieux <赫克托耳。在berkeley.edu rouxdebezieux >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“调味品”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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细节

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版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1)
进口	弹弓(> = 1.9),mgcv,RANN统计数据,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment跑龙套,magrittr,dplyr(> = 1.0),Ecume(> = 0.9.1)、方法pbapply,matrixStats,BiocParallel,TrajectoryUtils,igraph
链接
建议	knitr,testthat,rmarkdown,covr,冬青,ggplot2,RColorBrewer,randomForest,tidyr,TSCAN
SystemRequirements
增强了
URL	https://hectorrdb.github.io/condiments/index.html
BugReports	https://github.com/HectorRDB/condiments/issues
取决于我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	condiments_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	condiments_1.0.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	condiments_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/condiments
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/调味品
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/condiments/
包下载报告	下载数据