Compcoder.

DOI：10.18129 / b9.bioc.compcoder.

差分表达方法的差异表达分析和性能比较。

Biocometiond版本：释放（3.12）

该包提供了广泛的功能，用于比较通过不同方法获得的结果进行差异表达分析的结果。它还包含用于模拟计数数据的功能。最后，它为多个包提供了方便的接口，用于执行差异表达分析。这些也可以用作模板，用于在包的框架内设置和运行用户定义的差分分析工作流程。

作者：夏洛特·斯蒙顿[AUT，CRE]

维护者：Charlotte Soneson

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！quancamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“compcoder”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“COMPCODER”）

HTML.	r script.	Compcoder.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.26.1.
在生物导体中以来	BIOC 2.14（R-3.1）（7年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	SM.
进口	TCLTK，kn（> = 1.2），啰嗦那r那格子（> = 0.16），贡献那GTOOLS.那gdata.那厕所， 网格，kernsmooth.那大量的那ggplot2.那stringr.那最新版本那edger.那林马那vioplot.，方法，实用程序，统计数据，grdevices，图形
链接到
建议	生物焦那EBSEQ.那deseq2.（> = 1.1.31），贝凯（> = 2.2.0），Genefilter.那噪音那TCC.那nbpseq.（> = 0.3.0），RAMAMAMDOW.那testthat.
系统要求
加强	rpanel.那DSS.
URL.	https://github.com/csoneson/compcoder.
Bugreports.	https://github.com/csoneson/compcoder/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	compcoder_1.26.1.tar.gz.
Windows二进制文件	compcoder_1.26.1.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	compcoder_1.26.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/compcoder.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/抄波器
包短网址	https://biocumon.org/packages/compcoder/
包裹下载报告	下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包	源档案