comapr

DOI:10.18129 / B9.bioc.comapr

交叉分析和遗传图谱构建

Bioconductor版本:版本(3.16)

comapr检测交叉间隔为单身配子的单体型状态序列和商店农庄组织对象的跨界车。计算遗传距离可以通过映射函数使用交叉率估计制造商间隔。可视化功能策划基于间隔遗传图谱或累计实现遗传距离,有助于揭示跨界车景观在整个基因组的变化和个人。

作者:Ruqian律(aut (cre)

维护人员:Ruqian律< xiaoru。最佳:gmail.com >

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“comapr”)

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HTML	R脚本	Get-Started-With-comapr
HTML	R脚本	single-sperm-co-analysis
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	方法,ggplot2,reshape2,dplyr,gridExtra,情节,circlize,rlang,GenomicRanges,IRanges,foreach,BiocParallel,GenomeInfoDb,尺度,RColorBrewer,tidyr,S4Vectors跑龙套,矩阵、网格数据,SummarizedExperiment,plyr,Gviz
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat(> =魅惑,statmod
SystemRequirements
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包档案

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源包	comapr_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	comapr_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	comapr_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	comapr_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/comapr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ comapr
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/comapr/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/comapr/
包下载报告	下载数据