警戒线
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doi：10.18129/b9.bioc.cordon
密码子的使用分析和基因表达的预测
生物导体版本：版本（3.15）
用于分析各种未经注释或KEGG/COG注释的DNA序列中的密码子使用的工具。计算CU偏置和基于CU的基因表达性预测指标的不同度量，并对带注释的序列进行基因集富集分析。实现了可视化Cu和富集分析结果的几种方法。
作者：Anamaria Elek [Cre，Aut]，Maja Kuzman [aut]，Kristian Vlahovicek [aut]
维护者：gmail.com上的anamaria elek
引用（从r内，输入引用（“警戒线”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Cordon”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Cordon”）
| html | R脚本 | 警戒线 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.5） |
| 进口 | 方法，统计，utils，生物弦，，，，生物酶，，，，dplyr，，，，Stringr，，，，purrr，，，，GGPLOT2，，，，Data.Table |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/bioinfohr/cordon |
| BugReports | https://github.com/bioinfohr/cordon/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | vhcub |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Cordon_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cordon_1.14.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | Cordon_1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cordon |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/警戒线 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cordon/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
