彗星
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DOI:10.18129 / B9.bioc.coMET
彗星:区域表观基因组关联扫描(EWAS)结果和DNA共甲基化模式的可视化
生物导体版本:发布(3.13)
基因组区域EWAS结果可视化。除了表型关联p值，coMET还生成共甲基化模式图，并提供一系列注释轨迹。它可以用于其他全组关联扫描，只要数据可以翻译到基因组水平和任何物种。
作者:Tiphaine C. Martin [aut,cre]， Thomas Hardiman [aut]， idl Yet [aut]， Pei-Chien Tsai [aut]， Jordana T. Bell [aut]
维护人员:Tiphaine Martin < Tiphaine。马丁在mssm.edu >
引文(从R中输入引用(“彗星”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装软件包(“BiocManager”)::install(“coMET”)
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“彗星”)
| R脚本 | 彗星的用户指南 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (R-3.2)(6年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (>= 3.7.0)， grid, utils，biomaRt,Gviz,心理 |
| 进口 | 工具,哈希grDevices,gridExtra,rtracklayer,IRanges,S4Vectors,GenomicRanges统计数据,corrplot |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://epigen.kcl.ac.uk/comet |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | coMET_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | coMET_1.24.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | coMET_1.24.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coMET |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/彗星 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/coMET/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
