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- Bioconductor 3.15
- 软件包
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cn.farms
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DOI:10.18129 / B9.bioc.cn.farms
cn。农场——因子分析拷贝数的估计
Bioconductor版本:版本(3.15)
这个包实现了cn。农场拷贝数变异(CNV)算法分析。cn。农场可以分析最常见Affymetrix (250 k-snp6.0)数组类型,支持使用雪和ff高性能计算。
作者:Andreas Mitterecker Djork-Arne Clevert
维护人员:Andreas Mitterecker < Mitterecker在ml.jku.at >
从内部引用(R,回车引用(“cn.farms”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cn.farms”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“cn.farms”)
| R脚本 | cn.farms: Manual for the R package | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.44.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(11.5年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2.0) |
| 取决于 | R (> = 3.0),Biobase、方法、ff,oligoClasses,雪 |
| 进口 | DBI,affxparser,益生元,DNAcopy,preprocessCore,晶格 |
| 链接 | |
| 建议 | pd.mapping250k.sty,pd.mapping250k.nsp,pd.genomewidesnp.5,pd.genomewidesnp.6 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.bioinf.jku.at/software/cnfarms/cnfarms.html |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | cn.farms_1.44.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cn.farms_1.44.0.zip(64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | cn.farms_1.44.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cn.farms |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cn.farms |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cn.farms/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
