cmapR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cmapR

在R提出工具

Bioconductor版本:版本(3.16)

连接地图城市规划机构(CMap)是一个巨大的资源微扰基因表达谱由广泛的研究所的研究人员,由美国国立卫生研究院图书馆集成网络细胞签名(距离)计划。请访问https://clue。io的更多信息。cmapR包实现方法来解析、操作和写共同提出数据对象,例如带注释的基因集的矩阵和集合。

作者:Ted Natoli (aut (cre)

维护人员:Ted Natoli < ted.e。在gmail.com natoli >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cmapR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cmapR”)

HTML	R脚本	cmapR教程
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	方法,rhdf5,data.table,flowCore,SummarizedExperiment,matrixStats
链接
建议	knitr,testthat,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cmap/cmapR
BugReports	https://github.com/cmap/cmapR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cmapR_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	cmapR_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	cmapR_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64)	cmapR_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cmapR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cmapR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cmapR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cmapR/
包下载报告	下载数据