丛林

DOI：10.18129 / b9.bioc.clustcomp.

聚类比较包

Biocometiond版本：释放（3.12）

Clustcomp是一种包装，它可以实现多种技术，用于比较和可视化不同聚类结果之间的关系，平面与平坦或分层与平坦的关系。使用加权二图来显示集群之间的这些关系，其中节点表示具有非空交叉口的簇和边缘连接的节点对;每个边缘的重量是该交叉点中的元件数量，并通过边缘厚度显示。BaryCentre算法提供了Bi-Graph的最佳布局，其最小化了加权交叉数量。在比较分层和非分级群集的情况下，树木图在不同的高度下被修剪，通过深度首先搜索来探索树，从根目录开始选择。分支决定根据评分函数的值来分割，可以基于双图的美学或分层和平面集群之间的相互信息。通过贪婪算法构建来自每一侧的集群组之间的映射，并且可以另外可视化。

作者：Aurora Torrente和Alvis Brazma。

维护者：Aurora Torrente

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“clustcomp”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“CLUSTCOMP”）

PDF.	r script.	Clustcomp套餐
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.18.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 3.3）
进口	SM.，统计数据，图形，grdevices
链接到
建议	BioBase.那Colonca.那运行那生物根系
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	clustcomp_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件	clustcomp_1.18.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	clustcomp_1.18.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/clustcomp.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ clustcomp
包短网址	https://biocumon.org/packages/clustcomp/
包裹下载报告	下载统计信息