cliqueMS

DOI:10.18129 / B9.bioc.cliqueMS

注释的同位素,加合物和碎片将LC / MS代谢组学数据的加合物

Bioconductor版本:版本(3.16)

注释数据从液相色谱与质谱(LC / MS)代谢组学实验。基于网络算法(O。Senan a Aguilar车用汽油,m·纳瓦罗o .严,R。Guimera和m . Sales-Pardo,生物信息学,35 (20),2019),“CliqueMS”构建加权相似网络节点功能和边缘加权根据相似的特性。然后寻找最合理的相似性网络分成派系(完全连接组件)。最后它注释代谢物在每个小团体中,获得每个注释代谢物中性的质量及其特性,对应于同位素,电离加合物和碎片加合物的代谢物。

作者:Oriol Senan坎波斯(aut (cre),安东尼Aguilar-Mogas (aut),乔迪Capellades (aut),米里亚姆纳瓦罗(aut),奥斯卡燕(aut),罗杰Guimera (aut),玛尔塔Sales-Pardo (aut)

维护人员:Oriol Senan Campos < Oriol。在praenoscere.com senan >

从内部引用(R,回车引用(“cliqueMS”)):

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cliqueMS”)

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版本 1.12.2
Bioconductor自 BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.6.0)
进口 Rcpp(> = 0.12.15),xcms(> = 3.0.0),MSnbase,igraph,qlcMatrix,matrixStats、方法
链接 Rcpp,黑洞,RcppArmadillo
建议 knitr,rmarkdown,testthat,相机
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL http://cliquems.seeslab.net
BugReports https://github.com/osenan/cliqueMS/issues
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包档案

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源包 cliqueMS_1.12.2.tar.gz
Windows二进制 cliqueMS_1.12.2.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) cliqueMS_1.12.2.tgz
macOS二进制(arm64) cliqueMS_1.12.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cliqueMS
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cliqueMS
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/cliqueMS/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cliqueMS/
包下载报告 下载数据
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