快船
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doi：10.18129/b9.bioc.clipper
基因集分析利用途径拓扑
生物导体版本：版本（3.15）
使用两步经验方法实现拓扑基因集分析。它利用图形分解理论创建一个结树并重建最相关的信号路径。在第一步中，剪刀根据统计测试对途径的平均值和浓度矩阵选择了重要的途径。然后，它“剪辑”整个识别与特定表型具有最大关联的信号路径的途径。
作者：Paolo Martini
维护者：paolo martini
引用（从r内，输入引用（“快船”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Clipper”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“快船”）
| R脚本 | 快船 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（9。5年） |
| 执照 | AGPL-3 |
| 要看 | r（> = 2.15.0），矩阵，，，，图形 |
| 进口 | 方法，生物酶，，，，RCPP，，，，Igraph，，，，Grbase（> = 1.6.6），qpgraph，，，，kegggraph，，，，公司，，，，rbgl |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，石墨，，，，全部，，，，HGU95AV2.DB，，，，大量的，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | RCY3 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 石墨 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Clipper_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CLIPPER_1.36.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | Clipper_1.36.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clipper |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/快船 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/clipper/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
