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cliProfiler
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DOI:10.18129 / B9.bioc.cliProfiler
用于CLIP数据可视化的包
Bioconductor版本:发行版(3.16)
一种简单快速的方法来可视化和配置高吞吐量的IP数据。该包生成元基因概要文件和其他概要文件。这些剖面可以为理解IP实验结果提供有价值的信息。
作者:周游[aut, cre]
，凯西·扎纳克[au]
维护者:You Zhou
引文(从R内，输入引用(“cliProfiler”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“cliProfiler”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | cliProfiler小插曲 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | S4Vectors，方法，R (>= 4.1) |
| 进口 | dplyr，rtracklayer，GenomicRanges，ggplot2，BSgenome，Biostrings,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，bookdown，testthat，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Codezy99/cliProfiler |
| BugReports | https://github.com/Codezy99/cliProfiler/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | cliProfiler_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cliProfiler_1.4.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | cliProfiler_1.4.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | cliProfiler_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cliProfiler |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cliProfiler |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/cliProfiler/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cliProfiler/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
