circRNAprofiler

DOI:10.18129 / B9.bioc.circRNAprofiler

circRNAprofiler:环形rna下游分析的基于r的计算框架

Bioconductor版本:发行版(3.15)

基于r的计算框架，用于环rna的综合硅分析。这个计算框架允许组合和分析之前由多个公开的基于注释的circRNA检测工具检测到的circRNA。它涵盖了circRNAs分析的不同方面，从差异表达分析，进化保守，生物成因到功能分析。

作者:西蒙娜Aufiero

维护者:Simona Aufiero

安装

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如果(!install(" BiocManager"， quiet = TRUE))

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文档

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browseVignettes(“circRNAprofiler”)

超文本标记语言	R脚本	circRNAprofiler
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	dplyr，magrittr，readr，rtracklayer，stringr，stringi，DESeq2，刨边机，GenomicRanges，IRanges，seqinr，R.utils，reshape2，ggplot2跑龙套,rlang，S4Vectors统计数据,GenomeInfoDb，universalmotif，AnnotationHub，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，Biostrings，gwascat，BSgenome
链接
建议	testthat，knitr，roxygen2，rmarkdown，devtools，gridExtra，ggpubr，维恩图，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10，BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Aufiero/circRNAprofiler
BugReports	https://github.com/Aufiero/circRNAprofiler/issues
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包档案

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源包	circRNAprofiler_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	circRNAprofiler_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	circRNAprofiler_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/circRNAprofiler
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ circRNAprofiler
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/circRNAprofiler/
包下载报告	下载数据