Chromstar
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doi：10.18129/b9.bioc.chromstar
CHIP-SEQ数据的组合和差异染色质态分析
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包实现了CHIP-SEQ数据组合和差分分析的功能。它包括单变量和多元峰值电话，导出到基因组浏览器可查看的文件以及用于富集分析的功能。
作者：Aaron Taudt，Maria Colome Tatche，Matthias Heinig，Minh Anh Nguyen
维护者：aaron taudt
引用（从r内，输入引用（“ Chromstar”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Chromstar”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Chromstar”）
| R脚本 | Chromstar用户指南 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），基因组机，，，，GGPLOT2，，，，Chromstardata |
| 进口 | 方法，UTILS，GRDEVICES，图形，统计信息，foreach，，，，多帕尔，，，，生物基因（> = 0.31.6），S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，iranges，，，，RESHAPE2，，，，rsamtools，，，，基因组签名，，，，bamsignals，，，，mvtnorm |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，生物使用，，，，测试，，，，Biomart |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ataudt/chromstar |
| BugReports | https://github.com/ataudt/chromstar/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | chromstar_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | chromstar_1.22.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | chromstar_1.22.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chromstar |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/chromstar |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chromstar/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
