chromDraw

DOI:10.18129 / B9.bioc.chromDraw

chromDraw R包图纸方案的分析在线性和循环的方式。

Bioconductor版本:版本(3.13)

ChromDraw是画的R包核型的方案(s)在线性和循环的方式。它可以可视化细胞遗传学marsk染色体。这个工具有自己的输入数据格式。从GenomicRanges输入数据可以导入数据结构。这个包可以可视化数据在床上文件格式。这是要求床的前九个字段格式。输出文件格式是*。每股收益和* .。

作者:Jan Janecka Ing。,经理CEITEC马萨里克大学

维护人员:1月Janecka < 1月。在ceitec.muni.cz janecka >

从内部引用(R,回车引用(“chromDraw”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“chromDraw”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“chromDraw”)

PDF R脚本 chromDraw
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细节

biocViews bob 体育平台下载
版本 2.22.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.0.0)
进口 Rcpp(> = 0.11.1),GenomicRanges(> = 1.17.46)
链接 Rcpp
建议
SystemRequirements Rtools (> = 3.1)
增强了
URL www.plantcytogenomics.org/chromDraw
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 chromDraw_2.22.0.tar.gz
Windows二进制 chromDraw_2.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉) chromDraw_2.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chromDraw
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chromDraw
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/chromDraw/
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