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cellity
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DOI:10.18129 / B9.bioc.cellity
为单细胞RNA-seq数据质量控制
Bioconductor版本:版本(3.16)
支持向量机的方法来识别和过滤低质量细胞单细胞RNA-seq数据集。
作者:戴维斯托米斯拉夫•Illicic麦卡锡
维护人员:Tomislav Ilicic < ti243在cam.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“cellity”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cellity”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“cellity”)
| HTML | R脚本 | 介绍cellity包 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
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| 版本 | 1.26.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.3) |
| 进口 | AnnotationDbi,e1071,ggplot2、图形grDevices、网格mvoutlier,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,robustbase统计数据,topGO,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,脱字符号,knitr,testthat,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | cellity_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cellity_1.26.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | cellity_1.26.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | cellity_1.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellity |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellity |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/cellity/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cellity/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
