cellHTS2

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellHTS2

细胞筛选的分析- cellHTS的修订版

Bioconductor版本:发行版(3.15)

该软件包提供了以微滴定板格式(包括但不限于384孔板)进行的高通量分析的工具。功能包括数据导入和管理、规范化、质量评估、复制总结和统计评分。生成了一个网页，提供了数据和分析结果的详细图形化概述。在我们的工作中，我们已经将该软件包应用于苍蝇和人类细胞的RNAi筛选，以及酵母文库的筛选。参见?cellHTS2获得简要介绍。

作者:Ligia Bras, Wolfgang Huber ， Michael Boutros ， Gregoire Pau ， Florian Hahne < Florian。在novartis.com hahne >

维护者:Joseph Barry < Joseph。巴里在embl.de >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cellHTS2")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“cellHTS2”)

PDF	R脚本	主要插图(完整版本):基于单元格的屏幕的端到端分析
PDF	R脚本	主要插图:基于单元格的屏幕的端到端分析
PDF	R脚本	补充:enhancer-suppressor屏幕
PDF	R脚本	补充:多渠道化验
PDF		参考手册

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	2.60.0
Bioconductor自	BioC 2.1 (R-2.6)(15年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),RColorBrewer，Biobase、方法、genefilter，splots，vsn，hwriter，locfit、网格
进口	GSEABase，类别stats4,BiocGenerics
链接
建议	ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber
取决于我	imageHTS，staRank
进口我	gespeR，RNAinteract
建议我	bioassayR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	cellHTS2_2.60.0.tar.gz
Windows二进制	cellHTS2_2.60.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	cellHTS2_2.60.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellHTS2
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellHTS2
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellHTS2/
包下载报告	下载数据