- 首页
- Bioconductor 3.15
- 软件包
- celaref
celaref
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.celaref
单细胞RNAseq细胞集群参照标记
Bioconductor版本:Release (3.15)
在单细胞RNAseq实验的聚类步骤之后，这个包旨在根据与参考数据集的相似性为聚类建议标签/细胞类型。它需要每个基因的每个细胞的读取计数表，以及属于每个簇的细胞列表(用于测试和参考数据)。
作者:Sarah Williams [aut, cre]
维护者:Sarah Williams < Sarah。Williams1 at monash.edu>
引文(从R内，输入引用(“celaref”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“celaref”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 手册 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，SummarizedExperiment |
| 进口 | 桅杆，ggplot2，矩阵，dplyr，magrittr，统计，utils，rlang，BiocGenerics，S4Vectors，readr，宠物猫，DelayedArray |
| 链接 | |
| 建议 | limma平行,knitr，rmarkdown，ExperimentHub，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | celaref_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | celaref_1.14.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | celaref_1.14.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celaref |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/celaref |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/celaref/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
