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cbaf
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DOI:10.18129 / B9.bioc.cbaf
自动功能比较各种基因组数据从cbioportal.org
Bioconductor版本:Release (3.16)
这个包包含的功能可以很容易地分析和比较不同癌症/癌症亚组的基因组数据。到目前为止，它与存储在cbioportal.org上的RNA-seq、microRNA-seq、微阵列和甲基化数据集兼容。
作者:Arman Shahrisa [aut, cre, cph]， Maryam Tahmasebi Birgani [aut]
维护者:Arman Shahrisa < Shahrisa。Arman在hotmail.com>
引用(来自R，输入引用(“cbaf”)）:
安装
要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cbaf")
对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:
browseVignettes(“cbaf”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | cbaf |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
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| 版本 | 1.20.1 |
| 在Bioconductor中 | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | BiocFileCache，RColorBrewer，cBioPortalData，genefilter，gplots、grDevices、stats、utils、openxlsx |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 这取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。
| 源包 | cbaf_1.20.1.tar.gz |
| Windows二进制 | cbaf_1.20.1.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | cbaf_1.20.1.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cbaf |
| Bioc软件包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/cbaf/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cbaf/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| bioc3.16的旧源包 | 源存档 |
