卡斯珀
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doi：10.18129/b9.bioc.casper
基于配对末端读取的替代剪接的表征
生物导体版本：版本（3.15）
从配对端RNA-seq数据中推断出替代剪接。该模型基于跨外显子的计数路径，而不是成对的外显子连接，并非参数估算片段大小和启动分布，从而提高了估计精度。
作者：David Rossell，Camille Stephan-Totto，Manuel Kroiss，Miranda Stobbe，Victor Pena
维护者：David Rossell
引用（从r内，输入引用（“卡斯珀”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Casper”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Casper”）
| DesignRnaseq.pdf | ||
| R脚本 | 卡斯珀图书馆的手册 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.30.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（9。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.6.0），生物酶，，，，iranges， 方法，基因组机 |
| 进口 | 生物基因（> = 0.31.6），结尾，，，，ebarrays，，，，加加，，，，gtools，，，，GenomeInfodB，，，，GenomicFeatures，，，，林玛，，，，MGCV，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，S4VECTORS（> = 0.9.25），SQLDF，，，，生存，，，，VGAM |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | 平行 |
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| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | casper_2.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | casper_2.30.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | casper_2.30.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/casper |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/casper |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/casper/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
