cancerclass

DOI:10.18129 / B9.bioc.cancerclass

基于高维分子数据的诊断测试开发和验证

生物导体版本:发布(3.12)

分类协议从特征选择步骤开始,然后继续进行最近质心分类。预测器的准确性可以通过训练和测试集验证、留一交叉验证或多个随机验证方案来评估。连续预测评分的计算和可视化方法可以平衡敏感性和特异性,并根据临床需求确定临界值。

作者:Jan budcies, Daniel Kosztyla

维护者:Daniel Kosztyla

引文(从R中输入引用(“cancerclass”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("cancerclass")

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cancerclass”)

PDF R脚本 癌症类:用于开发和验证高维分子数据诊断测试的R包
PDF 参考手册

细节

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版本 1.34.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年)
许可证 GPL 3
取决于 R (> = 2.14.0),Biobase,binom、方法、统计数据
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建议 cancerdata
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 cancerclass_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 cancerclass_1.34.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) cancerclass_1.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cancerclass
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cancerclass
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cancerclass/
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