cbioportaldata
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doi：10.18129/b9.bioc.cbioportaldata
从cbioportal Web资源中曝光并提供可用数据
生物导体版本：版本（3.15）
CBIOPORTALDATA R软件包访问CBIO癌症基因组门户的研究数据集。它可以从预包装的zip / tar文件或CBIOPORTAL数据团队最近实施的API接口中访问数据。该软件包可以以表格格式或使用熟悉的生物导体数据表示形式提供数据。
作者：Levi Waldron [AUT]，Marcel Ramos [AUT，CRE]
维护者：Marcel Ramos
引用（从r内，输入引用（“ cbioportaldata”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ cbioportaldata”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Cbioportaldata”）
| html | R脚本 | CBIOPORTAL数据构建错误 |
| html | R脚本 | CBIOPORTAL快速启动指南 |
| html | R脚本 | CBIOPORTAL用户指南 |
| html | R脚本 | 从CGDSR迁移到Cbioportaldata |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.8.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.11（R-4.0）（2年） |
| 执照 | AGPL-3 |
| 要看 | r（> = 4.2.0），砧（> = 1.7.1），多亚sayExexperiment |
| 进口 | Biocfilecache（> = 1.5.3），消化，，，，dplyr，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，httr，，，，iranges， 方法，readr，，，，破烂的经历，，，，rtcgatoolbox（> = 2.19.7），S4VECTORS，，，，总结性特征，统计蒂布尔，，，，花花公子，，，，tcgautils（> = 1.9.4），UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，生存，，，，幸存者，，，，rmarkDown，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/waldronlab/cbioportaldata/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | CBAF |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | cbioportaldata_2.8.1.tar.gz |
| Windows二进制 | cbioportaldata_2.8.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | cbioportaldata_2.8.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbioportaldata |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/cbioportaldata |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cbioportaldata/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.15的旧源软件包 | 来源存档 |
