Bumphunter

doi：10.18129/b9.bioc.bumphunter

撞猎人

生物导体版本：版本（3.12）

在基因组数据中查找颠簸的工具

作者：Rafael A. Irizarry [Cre，Aut]，Martin Aryee [Aut]，Kasper Daniel Hansen [Aut]，Hector Corrada Bravo [Aut]，Shan Andrews [CTB]，Andrew E. Jaffe [CTB]，Harris Jaffee，Harris Jaffe [CTB [CTB [CTB]，Leonardo Collado-Torres [CTB]

维护者：Rafael A. Irizarry

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ bumphunter”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Bumphunter”）

PDF	R脚本	Bumphunter用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.32.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（8年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5），S4VECTORS（> = 0.9.25），iranges（> = 2.3.23），GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，foreach，，，，迭代器，方法，并行，Locfit
进口	矩阵，，，，林玛，，，，Dorng，，，，生物基因，utils，GenomicFeatures，，，，AnnotationDbi，统计
链接
建议	测试，，，，运行，，，，多帕尔，，，，org.hs.eg.db，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL	https://github.com/ririzarr/bumphunter
取决于我	Minfi
进口我	BrainflowProbes，，，，冠军，，，，damefinder，，，，德芬德，，，，DMRSEQ，，，，epivizr，，，，基因组态，，，，甲基接受，，，，methyvim，，，，recountworkflow，，，，rnaeditr
建议我	Bigmelon，，，，derfinderplot，，，，epivizrdata，，，，地区报告
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	bumphunter_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	bumphunter_1.32.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	bumphunter_1.32.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bumphunter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/bumphunter
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/bumphunter/
软件包下载报告	下载统计