- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- bugsigdbr
bugsigdbr
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DOI:10.18129 / B9.bioc.bugsigdbr
从BugSigDB R-side访问发表微生物签名
Bioconductor版本:版本(3.16)
bugsigdbr包实现方便的从在R / Bioconductor访问bugsigdb.org。计划的目标是促进BugSigDB数据导入R / Bioconductor,提供实用工具中提取微生物的签名,并使出口提取签名的格林尼治时间等标准文件格式的纯文本文件。
作者:路德维希Geistlinger (aut (cre),詹妮弗Wokaty (aut),李维沃尔德伦(aut)
维护人员:路德维希Geistlinger < ludwig_geistlinger hms.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“bugsigdbr”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“bugsigdbr”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“bugsigdbr”)
| HTML | R脚本 | R-side访问BugSigDB |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.1 |
| Bioconductor自 | BioC 3.14 (r - 4.1)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.1) |
| 进口 | BiocFileCache、方法、发呜呜声,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,ontologyIndex,rmarkdown,testthat(> = 3.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/waldronlab/bugsigdbr |
| BugReports | https://github.com/waldronlab/bugsigdbr/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | bugsigdbr_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | bugsigdbr_1.4.1.zip |
| macOS二进制(x86_64) | bugsigdbr_1.4.1.tgz |
| macOS二进制(arm64) | bugsigdbr_1.4.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bugsigdbr |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bugsigdbr |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/bugsigdbr/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bugsigdbr/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
| 老BioC 3.16源码包 | 源存档 |
