分支机构

doi:10.18129/b9.bioc.branchpointer

预测内含子剪接分支点

生物导体版本:版本(3.13)

预测内含子分支点窗口中站点的分支概率。查询可以作为内含子区域提供;或评估突变的效果,SNP。

作者:贝丝信号

维护者:贝丝信号

引用(从r内,输入引用(“ BranchPointer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ branchpointer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ branchpointer”)

PDF R脚本 使用branchpointer进行内含子人剪接分支的注释
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

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版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(4年)
执照 bsd_3_clause +文件执照
要看 商在,r(> = 3.4)
进口 plyr,,,,克恩拉布,,,,GBM,,,,Stringr,,,,牛仔图,,,,GGPLOT2,,,,Biomart,,,,生物弦,并行,utils,统计,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,rtracklayer,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,Data.Table
链接
建议 尼特,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 branchpointer_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 branchpointer_1.18.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) branchpointer_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/branchpointer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/branchpointer
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/branchpointer/
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