生物导体版本:版本(3.13)
预测内含子分支点窗口中站点的分支概率。查询可以作为内含子区域提供;或评估突变的效果,SNP。
作者:贝丝信号
维护者:贝丝信号
引用(从r内,输入引用(“ BranchPointer”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ branchpointer”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ branchpointer”)
R脚本 | 使用branchpointer进行内含子人剪接分支的注释 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(4年) |
执照 | bsd_3_clause +文件执照 |
要看 | 商在,r(> = 3.4) |
进口 | plyr,,,,克恩拉布,,,,GBM,,,,Stringr,,,,牛仔图,,,,GGPLOT2,,,,Biomart,,,,生物弦,并行,utils,统计,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,rtracklayer,,,,基因组机,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,Data.Table |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | branchpointer_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | branchpointer_1.18.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | branchpointer_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/branchpointer |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/branchpointer |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/branchpointer/ |
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