北欧化工

DOI:10.18129 / B9.bioc.borealis

在单分辨率Bisulfite-seq异常甲基化

Bioconductor版本:版本(3.16)

北欧化工是一个基于R库执行异常值分析点重亚硫酸盐测序数据。它从酸性亚硫酸盐测序检测异常甲基化CpG网站(BS-seq)。北欧化工的核心是建模Beta-Binomial分布。这对罕见疾病的诊断可能是有用的。

作者:Garrett詹金森(aut (cre)

维修工:Garrett詹金森< gargar934 gmail.com >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“北欧化工”)

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HTML	R脚本	北欧化工异常甲基化检测
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.2
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0),Biobase
进口	doParallel,雪,purrr,plyr,foreach,gamlss,gamlss.dist,bsseq、方法、DSS,R.utils,跑龙套,统计数据,ggplot2,cowplot,dplyr,rlang,GenomicRanges
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics,annotatr,tidyr,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,org.Hs.eg.db
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包档案

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源包	borealis_1.2.2.tar.gz
Windows二进制	borealis_1.2.2.zip
macOS二进制(x86_64)	borealis_1.2.2.tgz
macOS二进制(arm64)	borealis_1.2.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/borealis
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/好
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/borealis/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/borealis/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.16源码包	源存档