Bioconductor版本:发行版(3.13)
将常见的聚类算法封装在易于扩展的S4框架中。后端实现了分层、k-means和基于图的聚类。还提供了几个实用程序来比较和评估聚类结果。
作者:Aaron Lun [aut, cre], Stephanie Hicks [ctb]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内,输入引用(“咆哮”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“咆哮”)
超文本标记语言 | R脚本 | 1.聚类算法 |
超文本标记语言 | R脚本 | 2.聚类诊断 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.2.1 " |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | 统计,方法,效用,集群,矩阵,Rcpp,igraph,S4Vectors,BiocParallel,BiocNeighbors |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle,dynamicTreeCut,scRNAseq,天窗,嘘,食物,pheatmap,冬青,mbkmeans,kohonen,apcluster |
SystemRequirements | c++ 11 |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | OSCA。先进,OSCA。basic, OSCA.intro, OSCA。multisample, OSCA.workflows |
进口我 | scDblFinder,食物 |
建议我 | 后面;,dittoSeq,mbkmeans,mumosa |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | bluster_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | bluster_1.2.1.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | bluster_1.2.1.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bluster |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bluster/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
BioC 3.13的旧源包 | 源存档 |