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doi:10.18129/b9.bioc.biscuiteer

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生物导体版本:版本(3.15)

饼干输出的BSSEQ加载的测试安全带,在定义区域和可映射样品中对WGB数据的汇总,有或没有插补,大多数降低了NA行,年龄估计等等。

作者:Tim Triche [Aut],Wanding Zhou [Aut],Benjamin Johnson [Aut],Jacob Morrison [Aut,Cre],Lyong Heo [Aut],James Eapen [AUT]

维护者:雅各布·莫里森(Jacob Morrison)

引用(从r内,输入引用(“ Biscuiteer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Biscuiteer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Biscuiteer”)

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文本 消息

细节

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版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.1.0),Biscuiteerdata,,,,BSSEQ
进口 readr,,,,Qualv,,,,矩阵,,,,,,,,HDF5Array,,,,S4VECTORS,,,,rsamtools,,,,Data.Table,,,,生物酶,,,,基因组机,,,,iranges,,,,生物基因,,,,变体,,,,延迟的matrixstats,,,,总结性特征,,,,GenomeInfodB,,,,mus.musculus,,,,同性恋,,,,矩阵,,,,rtracklayer,,,,QDNASEQ,,,,DMRSEQ,方法,utils,r.utils,,,,gtools,,,,生物比较
链接
建议 DSS,,,,COVR,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,降价,,,,rlang,,,,Scmeth,,,,pkgdown,,,,roxygen2,,,,测试,,,,qdnaseq.hg19,,,,qdnaseq.mm10
系统要求
增强
URL https://github.com/trichelab/biscuiteer
BugReports https://github.com/trichelab/biscuiteer/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 biscuiteer_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 biscuiteer_1.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) biscuiteer_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biscuiteer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/饼干器
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biscuiteer/
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