- 家
- Bioconductor 3.13
- 软件包
- biomvRCNS
biomvRCNS
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DOI:10.18129 / B9.bioc.biomvRCNS
拷贝数为多元生物数据研究和细分
Bioconductor版本:版本(3.13)
在这个包中,一个隐藏的半马尔可夫模型(软件)和一个均匀细分模型设计和实现分割基因组数据,目的是协助记录检测使用高通量技术如RNA-seq或瓷砖数组,并使用aCGH或序列拷贝数分析。
作者:杨杜
维护人员:杨Du < tooyoung gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“biomvRCNS”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biomvRCNS”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“biomvRCNS”)
| R脚本 | biomvRCNS方案介绍 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.32.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(8年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | IRanges,GenomicRanges,Gviz |
| 进口 | 方法,mvtnorm |
| 链接 | |
| 建议 | 集群平行,GenomicFeatures,dynamicTreeCut,Rsamtools,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | biomvRCNS_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | biomvRCNS_1.32.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | biomvRCNS_1.32.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biomvRCNS |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biomvRCNS |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biomvRCNS/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
