biocGraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.biocGraph

在生物信息学和用例图示例

Bioconductor版本:版本(3.15)

这个包提供了例子和代码,利用不同的图包由Bioconductor有关。

作者:李长<李。在isb-sib长。ch >,罗伯特先生< rgentlem fhcrc.org >,赛斯猎鹰Florian Hahne < sethf fhcrc.org > < fhahne fhcrc.org >

维护人员:Florian Hahne <弗洛里安。在novartis.com hahne >

从内部引用(R,回车引用(“biocGraph”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biocGraph”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biocGraph”)

PDF R脚本 使用Rgraphviz绘制图表的例子
PDF R脚本 HOWTO布局通路
PDF 参考手册

细节

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版本 1.58.0
Bioconductor自 BioC 2.1 (r - 2.6)(14.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Rgraphviz,
进口 Rgraphviz,geneplotter,,BiocGenerics、方法
链接
建议 fibroEset,geneplotter,hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 EnrichmentBrowser
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 biocGraph_1.58.0.tar.gz
Windows二进制 biocGraph_1.58.0.zip
macOS 10.13(高山脉) biocGraph_1.58.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocGraph
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biocGraph
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/biocGraph/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网