bioCancer

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioCancer

交互式多组癌症数据可视化和分析

生物导体版本:发布(3.12)

bioCancer是一个可视化和交互式分析癌症基因组数据的闪亮应用程序。

作者:Karim Mezhoud

维护者:Karim Mezhoud

引文(从R中输入引用(“bioCancer”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!require ("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“bioCancer”)

超文本标记语言 R脚本 生物癌症:交互式多组学癌症数据可视化和分析
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细节

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版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证 AGPL-3 |文件许可证
取决于 R (> = 3.5.0),radiant.data(> = 1.0.6),cgdsr(> =)相对于1.2.6,XML(> = 3.99)
进口 闪亮的(> = 1.0.5),AlgDesign(> = 1.1.7.3),进口(> = 1.1.0)、方法shinythemes,Biobase,geNetClassifier,AnnotationFuncs,org.Hs.eg.db,剂量,clusterProfiler,reactome.db,ReactomePA,(> = 1.0.5),visNetwork,htmlwidgets,plyr,宠物猫,DT(> = 0.12),dplyr(> = 0.8.5)
链接
建议 BiocStyle,rmarkdown,knitr,testthat(> = 0.10.0)
SystemRequirements
增强了
URL http://kmezhoud.github.io/bioCancer
BugReports https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 bioCancer_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 bioCancer_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) bioCancer_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioCancer
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bioCancer
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bioCancer/
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